Архитектурный ансамбль был построен султаном Сулейманом Великолепным (Кануни ) для своего горячо любимого сына принца Мехмеда, которого собирался возвести на престол. Точная дата построения ансамбля не известна, но на саркофаге, который находится в усыпальнице принца Мехмеда, имеется надпись: «Мечеть была завершена в месяце Реджеп 930 г. (1543)». А в Тезкиретуль Бюньян (автобиография Мимар Синана) написано, что строительство ансамбля было начато в месяце Ребиюльэввел 950 г./Июнь 1543 г. Принц Мехмед скончался 16 Октября 1543 г., отчего и следует, что ансамбль не был предназначен для него, но после его смерти строению было дано его имя. Ансамбль находится в Эминоню в районе Шехзадебаши. Зодчий Мимар Синан называл ансабль «произведением подмастерья». Ансамбль состоит из пяти главных строений: мечеть Шехзаде, усыпальница Рустам Паши, усыпальница принца Мехмеда, Табхане (гостиница) и медресе.

Мечеть

Мечеть построена на участке площадью 38х38 м. с центральным куполом диаметром 19 м. и высотой 37 м., который посажен на четыре широкие колонны. Купол с четырех сторон поддерживается полукуполами. В мечети имеются два минарета с двумя шерефе на каждом, росписи и резьба на которых очень далеки от скромных архитектурных элементов того времени. Двор окружен девятью куполами одинаковой высоты и диаметра, которые вместе с шадырваном в центре двора представляют собой единое симметричное целое. Эвлия Челеби  повествует, что купол шадырвана был сооружен султаном Мурадом IV и восхваляет Мимар Синана за художественное оформление минаретов.

Другие сооружения

Усыпальница принца Мехмеда строилась с 1543 по 1544 гг. Стены усыпальницы облицованы фарфоровыми  плитами, а окна украшены витражами. В усыпальнице помимо принца Мехмета также захоронены усопший молодым брат Джихангир, дочь Хюмюшах, а также имеются три саркофага, имена чьих владельцев неизвестны.

Медресе, который представляет собой северо-восточную стену ансамбля, был построен с 1546 по 1547 гг. Здание состоит из 20 комнат, одной террасы и уборной. После 1950 г. оно было использовано в качестве общежития для девушек-учащихся. Состоящее из двух отделений Табхане, где обычно останавливались гости, как и медресе находится у восточной части стены внешнего двора.

Начальная школа, находящаяся на южной части ансамбля Шехзаде, в определенное время использовалось в качестве типографии Стамбульского Университета. Расположение окон помещения без навеса было изменено, а во время его использования в качестве склада был снесен ранее находившийся здесь очаг. Другим помещением, привлекающим внимание посетителей, является дарюззияфе (столовая), которая состоит из трех отделений.