Les Musées d’Archéologie d’Istanbul fondés en 1891 sous le nom de “Muze-i Humayun” (Musée Impérial) sont les premiers et les seuls fondations pionnières dans la structuration du muséum et des sciences de l’archéologie de notre pays. Tout d’abord, les “asar-i atika” (anciennes oeuvres)  rassemblées et conservées en 1266 (calendrier musulman), avec l’initiative de Fethi Ahmed Pacha, maréchal du Tophane-i Amire (bâtiment où se faisait la coulée des canons) dans l’Eglise de Aya Irini, ont attiré l’attention des visiteurs venant des pays étrangers. Ses visiteurs dits, s‘intéressaient aux armes de guerre appartenant à l’état, qui se trouvaient dans l’Eglise de Aya Irin et rassemblaient des informations concernant ceux-ci. Cela a provoqué une inquiétude du ministère de la défense. En conséquence, l'église a été évacuée et tous les anciens ouvrages ont été transportés aux chalet en faïence qui est un composant du Palais de Topkapi. Pour assurer la conservation de ces anciens ouvrages, le premier livre de statuts, préparé en 1874 et concernant tout particulièrement les archéologues étrangers, a été réorganisé en 1882 par Osman Hamdi Bey, conformément aux conditions actuelles. Ainsi, en 1883, l’Ecole “Sanayi-i Nefise” (école d’art), aujourd’hui utilisée en tant que Musée d’Oeuvres Anciennes de l’Orient, a été construite.

Alpay, a continué son discours en énumérant les articles du “Muze-i Humayun” dans la loi du ministère de l’éducation puis, a aussi parlé des oeuvres du musée et ainsi que du processus de structuration des Musées d’Archéologie composés de trois musées tels qu’ils ont été cités ci-dessus. On apprend par l’intermédiaire d’Alpay qu'une Archive de Documents Cunéiformes, est conservé et que les oeuvres des peuples anciens éthniques orientaux tels que les assyriens, le peuple du Royaume de Babylone, les Egyptiens, les Phéniciens, les Hébreux et les Hittites, sont éxposées dans Le Musée des Oeuvres de l’Orient. Le Musée d’Archéologie contient des pièces de monnaie aussi bien islamiques que non-islamiques appelées “meskukat” en ottoman et ainsi que des oeuvres appartenant à l’époque Byzantine et de la Rome antique telles que des sarcophages, des portraits et des statues puis également des oeuvres chrétiennes comme, des médailles et des marques et ainsi que des cachets. Le Musée d’Archéologie est aussi composé d’une bibliothèque. Les oeuvres islamiques et ainsi que des livres manuscrits de pachas, sont exposés et archivés dans le chalet en faïence. Autrement dit,  parmi la collection du musée il y a de riches et d’importants ouvrages appartenant aux civilisations des différents territoires de l'empire ottoman qui vont des Balkans à l’Afrique, ou encore de l’Anatolie et de la Mésopotamie à la Péninsule Arabe. L’archive du musée contient également environs 150.000 documents en dehors des documents archéologiques, datant de 1840, de l’époque du Sultan Abdulmecid, jusqu’en 1922. Ces documents sont des documents originaux concernant les écrits de correspondances officielles en Ottoman et en Français, qui ont été triés, catalogués, classés puis étudiés. Ainsi, l’archive des documents archéologiques en ottoman, a été fondée et incorporée à la direction des musées archéologiques. Alpay, a aussi parlé à propos des thèses de doctorat préparées avec l’aide des ressources de l’archive et ainsi que des travaux de structuration concernant les études et les tris de l’Archive des Documents Archéologiques en Ottoman, du Musée Archéologique d’Istanbul.

Après ses informations données concernant l’histoire, la structuration et la réorganisation des Musées Archéologiques d’Istanbul, Alpay a proclamé qu'il serait favorable d'écrire une pétition aux autorités concernées pour la réouverture de la salle d’archives qui est fermée aux lecteurs et aux rechercheurs depuis le 4 Janvier 2005. Il a continué en disant que la fermeture de la salle d'archive etait due à l'incompréhension ou la mauvaise interprétation des anciens ouvrages puis il a terminé son discours en instistant sur le fait qu’il était primordial de résoudre ce problème et de faire en sorte que la salle soit rouvert au public.

Le bâtiment de la bibliothèque du musée qui constitut une partie des Musées Archéologique d’Istanbul est situé à Eminonu, Istanbul et a été construit par le célèbre architecte et professeur de l’école “Sanayi-i Nefise Mekteb-i Alisi” (université d’art) Alexandre Vallaury. Les façades du nouveau bâtiment ont été soigneusement ornées selon les constructions anciennes et les façades extérieures ont été réalisées, paraît-il, en s’inspirant du sarcophage des pleureuses. Le musée est composé de grandes salles pour l’exposition et l’organisation. Ainsi, la première partie de cette construction authentique, a été inaugurée en 1891 et les autres parties en 1901 et 1907 avec l’autorisation du Sultan Abdulhamid II. La Bibliothèque du Musée, appelée aussi bibliothèque impériale, abritant une partie du musée archéologique, est placée à côté de la Chambre du Trésor qu
i se trouve au dernier étage sur la droite de l’entrée du bâtiment en forme de “U”.

Elle a été construite à deux étages et en bois jusqu’au plafond. L’accès à la bibliothèque se fait par une grande salle. Elle occupe une superficie d’environ 500 m2. Une grande partie de la bibliothèque a été réalisée par la donation et l’achat de livres qu’Osman Hamdi Bey a fait. Les manuscrits et les oeuvres imprimés détiennent une place importante dans la bibliothèque et augmente de jours en jours. Cette bibliothèque, composée de livres en différentes langues concernant, la science, l’archéologie, l’histoire de l’art et l’histoire, n’est plus limitée en tant que bibliothèque spécialisée. Elle contient également des livres en dehors des livres spécialisées dans un domaine et ainsi que des périodiques d’archéologie. Par ailleurs, il y a également une collection formée par des donations de livres telles que, La Collection d’Ahmet Cevat Pacha, de Mehmed Sakir Pacha, du Sultan Mehmed Resat V, de Sait Pacha de Diyarbakir, de Recaizade Ekrem, de Muztaza Hocazade Hatice Hanim, de Zeki Megamiz, de Karman Büyükkaya et de H.Turan Daglioglu.

Pour pouvoir travailler dans cette bibliothèque il est nécessaire d’obtenir une licence de la direction des Musées d’Archéologie d’Istanbul.