La Mosquée de Fethiye est un monument structuré en tant qu’église, vers la fin du 13e siècle par Le Byzantin Mihail Glabas Tarkaniotes. Elle est située dans le quartier de Carsamba, à Fatih sur une colline près de la Corne d’Or. Après la conquête d’Istanbul, Le Patriarcat Orthodoxe a été emménagé dans cette église en 1455 sur l'ordre du Sultan Mehmed II le conquérant. Par la suite, l’église a été transformée en mosquée en 1595 en l’honneur des conquêtes de la Géorgie et de l’Azerbaïdjan et ainsi elle prit le nom de mosquée de Fethiye.  Après la transformation de l’église en mosquée, la partie du sanctuaire de l’église a été détruite et un bâtiment en coupole abritant un mihrab, un minaret et une médersa qui encercle la cour sur trois cotés ont été ajoutés au monument.

La Mosquée de Fethiye a été restaurée en 1845. Par la suite, au début du 20e siècle, une école primaire a été bâtie sur l’emplacement de la médersa et les murs de la cour extérieure ont été supprimés. Ainsi l’intégralité du complexe s'est anéantie. D’autre part, elle a été rénovée par la direction des fondations  entre les années 1936 et 1938 et a été transformée en un musée sous la possession de la direction des musées. À cette période, la mosquée de Fethiye n’a pas vraiment été entretenue. En 1960, elle a été retransformée en mosquée et la chapelle du cimetière additionnelle à côté de la construction, a été restaurée par l’Institut de Byzance. Lors de ces travaux de restauration, les mosaïques et les fresques de la chapelle du cimetière annexé,  ont été reformées.