Die Zeyrek Moschee befindet sich in der Provinz Fatih, Kreis Zeyrek, Atatürk Boulevard  auf dem Ibadethane Weg mit einer Aussicht zum Goldenen Horn hinaus auf einer Hügel und ist auch einer unserer Tempel, die von einer Kirche zur Moschee umgebaut wurde.

Das Gebäude, dass in den letzten Mittleren Byzantinischen Zeiten gebaut wurde und es uns bekannt ist, dass es eine der Pantokrator Kloster Kirchen ist, wurde auf Anweisung der Tochter des Ungarischen Königs Laszlo, die auch die Frau des II. Joannes Komneos war. Die Kirche wurde bei der lateinischen Okkupation zerstört und die Kirche wurde dem nach von den Katholischen Pfarrern beschlagnahmt. Das  Pantokrator Kloster wurde nach der Eroberung von Istanbul, bis zu dem Bau der Fatih Komplex Medressen als Medresse benutzt. Die Moschee erhielt den Namen Zeyrek von dem Lehrer Molla Zeyrek Mehmed Efendi, der ein Lehrer an der Medresse war. Die Zeyrek Moschee wurde im 18. Jh. Komplett renoviert und Parallel zu der Einsicht des Architekten treten hier Zeichen der Barock Art hervor. Bis zu den 1950“er Jahren war die Moschee ziemlich ausgenutzt und wurde 1966 durch die Stiftungsverwaltung restauriert, bei dieser Restauration wurde der Holz Bodenbelag rausgerissen und so kamen die Verzierten Bodenbelege ins Tageslicht. Ebenso wurde die Galerie der Kariye Moschee hierher verfrachtet und es wurde ein Gebetsplatz errichtet. Es sind keine auffallenden Zeichen und Relikte des Pantokrator Klosters mehr zu sehen. Aber um die Moschee befinden sich Zisternen in diversen Größen, die unter dem Kloster waren.

Die Zeyrek Moschee, die in der Byzantinischen Zeit die Kirche des Klosters war besteht aus drei Gebäuden. Man schätzt, dass es, das Gebäude südlich des ersten Bereiches war. Die Zeyrek Moschee mit einem Minarett und einer Galerie, wurde aus Ziegelsteinen gebaut und mit fünf Kuppel wurde die Deckenbedeckung hergestellt.

Der Bau, der heutzutage nicht mehr in einem guten Zustand ist, führt die Besucher heute in einer geschichtlichen Zeitreise.