Das Militär Museum ist an die Militär Verwaltung Militär Geschichte und strategische Studien Verwaltung (ATASE) verbunden und befindet sich heutzutage in dem Gebäude und in den Anbauten der Kriegsschule, das in den letzten Zeiten des Osmanischen Reiches in Harbiye benutzt wurde.

Nachdem Fatih Sultan Mehmet Istanbul erobert hat, hat er die Aja Irene Kirche zum Waffenlager gestaltet und 1726 wurde das historische Gebäude durch den III. Ahmet renoviert und die Waffen so eingeordnet, dass die besichtigt werden können, somit wurde das Fundament des Museums gegründet. Nach den Regelungen von dem III. Ahmet wurde am Eingang eine Inschrift aufgesetzt, auf dem "Darü'l Esliha" geschrieben war. Wehrend der III. Selim im Jahr 1807 entthront wurde, ist das Gebäude durch die Waffenbauer beraubt und 1826 wurden nach der Auflösung der Janitscharen Truppe auch viele Werke der Janitscharen vernichtet.  Nach diesen Verfahren verlor das Gebäude die Bedeutung und wurde 1839 wurde es wieder zur Harbiye Waffenlager gestaltet und wurde weiterhin als Waffenlager verwendet. Später wurden durch die Tätigkeiten des „Tophane Müşiri Ahmed Fethi Pascha“ einige Werke aus der Aja Irene Kirche wieder gesammelt und im Jahr 1846 wurde das erste Türkische Museum aus Zwei Teilen mit den Namen "Mecma-i Esliha und Mecma-i Asar-ı Atika" in Moderner Art erstellt, aber dieses Museum wurde in der Zeit des Sultan Abdülaziz (1861-1876) wiederholt zum Waffenlager umgestaltet. In dem Teil Mecma-i Esliha, das gleichzeitig den Kern des Waffenmuseums bildete, befanden sich Waffen, Beile, Schwerte, Helme, Militär Wagen, u. ä. Werke, in dem Teil Mecma-i Asar-ı Atika befanden sich Mumien aus Ägypten, Keramik Produkte, Inschriften und Sarkophagen, die dann später in das Archäologische Museum verfrachtet wurden. 

Nach der Ankündigung des II. Reform, wurden durch die Bestrebungen von dem Tophane Feldmareschals Ali Rıza Pascha und des Mühendishane-i Berri-i Hümayun (Ingenieur Sekretär) Ferik Ahmet Muhtar Pascha wurde ein Ausschuss gegründet, um das Museum neu Einzurichten. Dieser Ausschuss bemühte sich, die Werke des Museums, die überall hin Zerstreuet wurden, nochmals zusammen zu bekommen. Nach diesen Tätigkeiten wurden die meisten Werke wieder in der Aja Irene gesammelt und das Museum wurde unter dem Namen “Müze-i Askeri-i Osmani" wieder in Betrieb gesetzt und es wurden durch die “Mehteran Gruppe” gelegentlich Konzerte veranstaltet.

Nach dem der II. Weltkrieg begann, wurden die Werke in der Aja Irene wegen Sicherheitsgründen nach Niğde verfrachtet. Nach dem II. Weltkrieg wurde die Kollektion aus 7000 Teilen von Niğde nach Maçka in das Waffenwerk (Silahhane) verfrachtet und das Waffenwerk wurde an die Istanbul Technische Universität übertragen, demnach wurden dann die Werke 1955 nach Harbiye in die alte  Sporthalle geliefert um in dem Gebäude Renovierungen durchzuführen. Im Jahr 1967 bekam das Gebäude ihr neues architektonisches Aussehen durch den Architekten Nezih Elden. Ein Teil des Militär Museums wurde zwar 1986 in Betrieb gesetzt aber gänzlich konnte es erst 1993 in Betrieb gesetzt werden.

Medaillen, Militär Kleidungen, Fahnen und Flaggen, Panzer Hemden, Panzerschilder, Gemälden, diverse Waffen, zeigen uns die Entwicklung und Veränderung unserer Militär. Es befinden sich hier gesamt 55000 Teile von denen 5000 für die Besucher ausgestellt werden. In der unteren Etage des Museums befindet sich die Fatih und Yavuz Ecke, Saal der Waffen, Kanonen Modelle Saal, Atatürk Lehrklasse, Reitsaal, Sall von Somalia – Bosnien - Kosovo und innere Sicherheit,   Flaggen und Fahnen Saal, Marine Ecke, Gefallenen Galerie, Zelten Galerie und ein Saal für die Militär Kleidungsstücke, in der oberen Etage des Museums; Saal für Ethnographische Werke, Atatürk Saal, Handgeschriebene Werke und Ferman und Zertifikate Saal, Saal der Çanakkale Kriege, Saal des I. Weltkrieges, Saal der Legalitätsperiode, Korea und Zypern Saal, Generalstabpräsidenten Saal, Saal des Unabhängigkeitskrieges.

Unter der reichen Kollektion von dem Atatürk Museum; befinden sich die vierzehn Schwerte von Kanuni Sultan Süleyman und das Zubehör seines Pferdes, bestickte Flaggen der Memluk Sultane und der Iran Könige, die Kette, die von den Byzantinern bei der Eroberung von Istanbul durch Haliç gezogen wurde, Schwerte des Kreuzzuges, die Kanone, die durch ein Unfall den II. Mahmut verletzte und noch viele weitere Gegenstände von Atatürk. Es werden auch Täglich an den offenen Tagen des Museums zwischen 15.00 -16.00 ein Konzert durch die „Mehteran Gruppe“ gespielt, es werden auch diverse Ausstellungen in dem Hasan Rıza Ausstellungssaal gemacht, die von den Museum Besuchern immer mit Interesse in Anspruch genommen werden.